Original: https://schneider.ncifcrf.gov/delila.html
Включаючи Послідовність Логотипів та Послідовність Ходока
Програми Delila були розроблені, щоб маніпулювати набори фрагментів послідовності. Деякі з цих програм використовуються для створення логотипів послідовності і ходоків послідовності в той час як інші інструменти, які я вважаю корисними, такі як rembla і програми TheThe.
Закони Арнольда Документація:
(1) Якщо воно повинно існувати, це не так.
(2) Якщо вона дійсно існує, це застаріло.
(3) Тільки документація непотрібні програми виходить за рамки перших двох законів.
Delila Програмне забезпечення: Binary і вихідний код
Як налаштувати програми Delila? Це для людей, які не знайомі з операційними системами Unix.
Як побудувати бібліотеки Delila
Підручник по Delila Інструкції
Які програми мені потрібно зробити логотипи на моєму власному комп’ютері? (Примітка: Ви можете зробити свої власні логотипи послідовності в Інтернеті: з WebLogo Стіва Бреннера ви можете створити свій власний логотип послідовності – просто поставити файл формату FASTA Це не настільки потужним, як за допомогою програм безпосередньо, але це працює для багатьох цілей .. )
Відкрита книга перелік всіх Delila програм: Інструкція по експлуатації сторінок, вихідний код і виконувані файли надаються. Вони не включають в себе програми, які роблять ходунки і індивідуальні інформаційні викладки.
Як отримати програми Індивідуальні теорії інформації і Уокер?
Що в індивідуальній інформації про програму пакета?
Даліла (дезоксирибонуклеїнової кислоти БІБЛІОТЕЦІ LANGUAGE) є мовою для вилучення наборів фрагментів послідовності з бази даних. Мова має формальне визначення.
Відкрита книга гіпертексту версія основного Delila Керівництво (176038 байт) Оригінальний плоский варіант Керівництва Delila тут, і версія PostScript Керівництва Delila тут. Примітка: Я не оновлювати ці керівництва часто. Для отримання самої останньої версії, отримати довідкову сторінку для кожної програми з вихідного коду.
Список використаної літератури для Delila системи
@article{Schneider1982,
author = "T. D. Schneider
and G. D. Stormo
and J. S. Haemer
and L. Gold",
title = "A design for computer nucleic-acid sequence storage,
retrieval and manipulation",
journal = "Nucl. Acids Res.",
volume = "10",
pages = "3013-3024",
year = "1982"}
@article{Schneider1984,
author = "T. D. Schneider
and G. D. Stormo
and M. A. Yarus
and L. Gold",
title = "Delila system tools",
journal = "Nucl. Acids Res.",
volume = "12",
pages = "129-140",
year = "1984"}
FTP-архів
Примітка: В архіві FTP існував до цих веб-сторінок. Я тримаю ці покажчики тут на даний момент, але вони в значній мірі застаріли.
FTP сайт Delila містить інструменти для маніпуляції послідовності і інших задач. Інформація про те, як налаштувати програми Delila знаходиться в README.
Примітка: Наш FTP-сайт змінений з “ncifcrf.gov” до “ftp.ncifcrf.gov”. Будь ласка, використовуйте нове ім’я в майбутньому. Якщо ви отримали пакет наших робіт до 6 квітня 1994 року, зверніть увагу на зміни на сторінці обкладинки, на сторінці 820 Шенер і ін паперу і на стор 6100 паперу логотипи послідовності.
